Handbookアプリのセクション表示ではPowerPointのアニメーション実行には対応していません。
Microsoft PowerPointの「ファイル」メニューの「エクスポート」からビデオを作成すると、アニメーションが保存された動画ファイル(.mp4)が出力されます。こちらの動画形式はHandbookアプリで再生可能ですので、こちらの代替手段での対応を検討してください。